位於台南市山上區、曾文溪下游的玉峰堰是一座家用水庫，每天供給台南3~5萬噸自來水。但為了保護水質劃設的「玉峰堰自來水保護區」，因擋下許多開發，包括行政院長賴清德在台南市長任內等地方政商，一直積極推動解編保護區，但因種種因素未成功。最近傳出行政院將核定前瞻基礎建設經費25億，將玉峰堰改工業專管，一旦玉峰堰不再是家用水庫，自來水保護區就自然解編了。
依照經濟部水利署的說法，因為玉峰堰旁的山上淨水廠設施不足，必須再送到潭頂淨水廠做二次處理才能納入台南供水系統。如果做一條工業專管專供南科用水、同時更新山上淨水廠，每天會多出10萬噸水源可運用。
但這只是表面的說法，玉峰堰水源現況本來就有供給南科用水，而山上淨水廠要不要更新，也跟是否做工業專管無關。南科用水2026年將從現況每天13萬噸，成長到32.5萬噸，這個水源也早有規劃，24.25萬噸由自來水供水系統供給，不足的8.25萬噸，已計畫興建四座再生水廠，並不需要再從玉峰堰特別拉一條工業專管供水。所以重點還是為了解編玉峰堰自來水保護區。
先要解編水源區，才有玉峰堰的專管計畫
這點從以下幾分文件看出是先有解編水源保護區的想法，然後才有工業專管的規劃。也因為用水標的變來變去，專管的工程經費沒有人要出，現在有了前瞻基礎建設，行政院就叫全民埋單，直接就打算核了。
台灣自來水公司(玉峰堰的主管機關)於2009年7月提出「曾文溪玉峰堰水源改供工業用水專供樹谷園區計畫報告」，內文提到「玉峰堰保護區因影響地區開發，地方強烈要求解編」。自來水公司還擔心「改工業用水後會影響供水調度，須移用嘉南水利會的農業用水，勢必增加本公司營運負擔」。
經濟部也不清楚到底工業專管要供水給誰，規劃變來變去。2009年6月18日召開「玉峰堰水源專管供應樹谷園區使用」會議，會議結論：玉峰堰水源如需配合曾文溪自來水水質水量保護區相關政策解編，而須調整供水標的時，原則以改工業用水，專供樹谷園區較可行…。」
另一份是「曾文溪玉峰堰水源送供台南科學園區可行性報告」，這次供水對象又變成南科。內文提到：台南縣政府為能解編該保護區，依2003年12月5日縣府召開研商「變更曾文溪玉峰堰水源用途可行性」，由台水公司配合探討將該水源改為工業用水送台南科學園區之可行性…。」
今年5月完成的「玉峰堰工業用水專管必要性評估」則明確指出，因南科未來用水爆漲，樹谷園區發展已停滯不需要多供水，所以專管將供給南科。
台南政商，積極推動解編玉峰堰水源保護區
解編玉峰堰的壓力也不是水利署擋得了的。2014年前台南市議會議長李全教競選「楠西、南化、玉井、左鎮」市議員時，提出最重要的政見就是「爭取山區水源保護區解編」，結果高票當選。
2015年10月19日，國民黨立委翁重鈞、黃昭順、李貴敏在立法院經濟委員會提案通過，請經濟部評估將玉峰堰從目前的家用水庫，改為專管供給工業用水。一周後，立法院經濟委員會邀請時任經濟部次長楊偉甫到玉峰堰現勘，李全教還到場當面要求解編，楊偉甫也回應表示認同。
賴清德在台南市長任內對解編也全力支持，2015年10月26日李全教在市議會質詢玉峰堰解編時，賴清德回答：「這是市府跟水利署一直在推動的政策」。
2013年8月環保署修訂「應實施環評認定標準」，將水庫集水區的環評規定分兩級處理，第一級比較嚴、第二級則放寬。時任台南市水利局長、現任台南市代理市長李孟諺還特地到公聽會，要求玉峰堰應改列為第二級水庫集水區。
玉峰堰集水區解編，不當開發將進駐
那玉峰堰自來水保護區到底擋到誰的開發？依自來水法11條規定，一旦劃設為水質水量保護區，就可禁止或限制貽害水質與水量的行為，包括濫伐林木或濫墾土地、土石採取或探礦、污染性工廠、設置垃圾掩埋場或焚化爐、傾倒、施放或棄置垃圾、興建放射性廢棄物儲存或處理場所等等。
此外還擋到一個有名的開發案「統一夢世界」，開發者是統一集團為了開發此案成立的統樂公司，基地位於台南市玉井區、也就是玉峰堰保護區內，面積152公頃。要蓋國際觀光旅館、主題遊樂區、休閒渡假旅館，房間數高達1,800間，未來的營運目標是每年帶進200萬次遊客。
遊樂區雖不必受限於自來水法11條的規定，但定義上「家用水庫集水區」就是「重要水庫集水區」，依內政部「非都市土地開發審議作業規範」規定，重要水庫集水區禁止開發，因此2016年7月14日內政部否決了這個開發案。
當時，統樂公司總經理廖本庸表示，經濟部水利署正在檢討將玉峰堰從民生用水變更為工業用水，等到玉峰堰不再是第一級敏感區時就可以開發了。而如果行政院真的核定玉峰堰工業專管，就真的如統樂公司所願。
去年行政院核定前瞻基礎建設，其中水環境建設8年2507億，創下史上最高治水經費，一年向全民舉債300億，當時說要重整水環境，有人質疑是否會編列玉峰堰專管時，水利署還鄭重否認。如今拿治水的錢、何況還舉債，卻做可能破壞水源區的事，這是對人民的背信、也違背編列前瞻建設的原意。
