世界衛生組織專家訪問中國之後（未進入武漢），與中國官方於在2月16日到24日合作調查，前日發布的調查報告「Report of the WHO-China Joint Mission on Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)」，其中公布的基因相似度指出，武漢肺炎（新冠病毒）已有多種變異，而與其基因最相近的就是舟山蝙蝠病毒，這株病毒是解放軍研究單位公開發表在論文，全球獨家發現的病毒，意味著武漢肺炎病毒就是來自中國。
世界衛生組織（World Health Organization, WHO）在武漢肺炎疫情爆發以來表現荒腔走板，但由專業科學團隊組成的調查團，在未能抵達武漢，以及完全仰賴中國官方提供數據之下，還是完成了新冠病毒調查報告（下文附超連結），即便有中國專家參與，結論中還是有打臉中國官方的說法，其中無法否認的是，與武漢肺炎病毒最接近的病毒基因，就是舟山蝙蝠病毒。
引用中國數據仍指，武漢肺炎病毒激似舟山蝙蝠病毒
在WHO報告的第5頁比對了近年各冠狀病毒基因圖索，包括2003年的SARS病毒、2015年韓國的MERS病毒，指出兩大重點，第一，武漢肺炎病毒已經產生多種的微變種（英國與巴西有兩例大變種，不在此報告中）。第二，與武漢肺炎病毒最接近的就是ZC45、ZXC21的舟山蝙蝠病毒。
WHO報告中的ZC45、ZXC21舟山蝙蝠病毒並不陌生，早在今年1月19日美國華人自媒體《路德社》的直播中首度披露，此一舟山蝙蝠病毒最早發表，全球獨家發現的作者就是解放軍南京軍區，並將成果發布在國際知名病毒期刊Emerging Microbes & Infections（EMI）上，該篇論文「GENOMIC CHARACTERIZATION AND INFECTIVITY OF A NOVEL SARS-Like coronavirus in chinese bats」就提到了「Analyses of the two new SL-CoVs from Zhoushan (ZXC21 and ZC45) 」。
至於中國武漢P4研究員石正麗曾說來自於雲南菊頭蝙蝠病毒，該說法完全沒有被WHO採信，更不用說其他中國官方或媒體刻意提到的果子狸、穿山甲、蛇、老鼠都被排除，至於中間宿主，雖然有香港政府對SARS的調查研究的流行病學家吳錦祥發表認為是當地老鼠，但WHO的報告指原因人傳人傳，播途徑以飛沫為主。
舟山蝙蝠病毒2年前發布，是中國解放軍獨家發現
至於最早發源地，WHO的報告強調，根據中國提供資料，認定華南海鮮市場是來源，但報告不接受來自於吃蝙蝠感染，「據信在武漢發現的早期病例是從人畜共患病源感染的，因為許多人報告曾在華南海鮮批發市場參觀或工作，截至2月25日，尚未確定動物來源。」
報告中還指出，爆發的早期即有證據人傳人，社區爆發早於武漢採取防疫措施，言下之意，中國官方一開始說的不會人傳人、可控、可防都是錯誤的。但報告中提到，根據中國提供的數據，中國稱，所採取的措施已有效遏止社區感染。
至於那些人容易被感染，根據中國的樣本，發病人群男女各半，77.8％的病患集中在30到69歲，年輕的個案少，致死率低，僅2.4％的患者低於18歲。在全球其他國家，死亡的患者多半高齡者。
WHO建議，各國對於輸入性案例，應立即升到最高等級，由政府與社會共同採取公共衛生措施，加強公眾教育，並展開對病毒傳播鏈的監控。
WHO報告打臉鐘南山，間接證實病毒來自中國
值得注意的是，武漢肺炎來自舟山蝙蝠病毒、會人傳人、將全球大爆發、年輕人比較不容易被攻擊等特徵，在今年1月19日美國華人自媒體《路德社》根據專家的爆料，就點出這些特性，如今在WHO的報告中得到證實。《路德社》更點名來自於武漢P4實驗室，是人造的病毒。
《路德社》指出，為什中國官方一直隱瞞疫情、拖延真相的揭露、不肯承認是舟山蝙蝠病毒，因為一旦承認就等於承認武漢肺炎病毒來自於中國解放軍，也打臉了所謂鴻海最高抗新冠病毒顧問、SARS專家鐘南山所言「病毒不一定來自中國」的說法。
另俄國衛生部的報告雖然未使用「人工」字眼，但其敘述的內容病毒非自然形成、不可能存在動物體內就是指來自實驗室。以色列軍事情報官員丹尼·肖漢姆（Dany Shoham）說，武漢病毒研究所與北京的祕密生物武器項目有關，並爆料中國還有3個生物戰實驗室。他說「武漢肺炎這種致命的動物病毒流行病可能在全球範圍內傳播，其起源是與中國秘密生物武器計劃有關的武漢實驗室。」
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