台鐵太魯閣號事故，交通部長林佳龍提出請辭，但蔡英文總統與行政院長蘇貞昌在肯定其願承擔政治責任之餘，亦慰留他先處理善後，蘇貞昌說，政府對這麼大的災難，當然要負責任，但政府要做的事情很多；現在以搶救、搶通為重，至於後續政治責任問題，還沒討論。
爽缺人人搶，台鐵黑洞沒人敢去
太魯閣號離譜的撞上工程車，有人形容太魯閣號是「受害者」，邊坡工程改善的義祥工業社才是加害者，現在卻是受害者要被檢討、改善，連交通部長也要請辭，有道理嗎？然而，即使太魯閣號本身沒有錯，義祥工業社也是台鐵招標來的廠商，在連假期間繼續上工，且未做好安全措施，是台鐵管理上的疏失。
換句話說，台鐵無論如何都要負起相當責任，只不過，台鐵局在張政源離退後，就沒有正式局長，已懸缺一段時間，充分顯現「爽缺人人搶，台鐵這個大黑洞沒人敢去」的官場現形記。
只是蘇貞昌與林佳龍商量後，由交通部次長祁文中代理。這次事件後，祈文中或可不再代理，亦有人認為，台鐵局的副局長，恐怕也要有所表示，或是「被整頓」。
根據「台灣鐵道暨國土規劃協會」日前的說法，指台鐵局長由交通部次長暫代，導致安全管理體系混淆；就台鐵管理架構而言，台鐵是營運者，也是該工程區域的發包單位，交通部與鐵道局是監理機關，如今由交通部次長代理局長，則交通部角色是營運者？監督營運的上級？還是監理者？
次長代理局長，衍生管理系統錯亂問題
鐵道學會認為，基於安全立場，避免組織文化所產生的安全盲點，監督體系必須層層分立，不該混為一談，交通部主管的民航體系、公路體系都明瞭的管理原則，為何唯獨鐵路始終是一團爛帳？
不過，蘇貞昌與林佳龍，似乎沒有發現，或是知道卻予以忽略「次長代理局長」的結果，會出現管理系統混淆的問題。
林佳龍會提出請辭，並不意外，負起政治責任，只是時間問題，於國民黨執政時，在野黨同樣會有這樣的批判，且力道更大。林佳龍暫留，是好是壞，還是立刻走人，由新人全權處理搶救與善後工作？若只是暫留，意義不大，更多不利林佳龍的言語，可能陸續出籠，有人建議，包括府院黨，應在最適當的時間，做更適當的政治停損。
柯文哲的「瑞士乳酪理論」
台北市長柯文哲說，「一個人的去留不是那麼重要」，「有時候留下來承擔更困難。」他強調，重大事件都是許多因素累積，這是所謂「瑞士乳酪理論」，即意外總在種種錯誤及疏漏中發生，所以要系統性解決。柯文哲認為，這不會是單一事件，涉及許多環節，必須完整檢討、一一解決。
雖然林佳龍的政績表現不錯，歷次的民調都在內閣名列前茅。又根據輿情民調網站「聲量看政治」在5日的統計指出，「包商李義祥在近幾天全部是負面討論，台鐵聲量最大，但以負面為主」。其中，被討論最多的是台鐵本身的救援處置與過去至今累積的沉痾問題；其次，是太魯閣號的救援進度；第三，是追究事件主要肇事責任者李義祥的責任；最後，才是對林佳龍的救援過程，以及政治責任的討論。
值得觀察的是，林佳龍請辭，即有民進黨內派系躍躍欲試，但是國民黨要求蘇貞昌與林佳龍都要下台，又讓民進黨有凝聚現象。
民進黨也許考量到，換交通部長容易，換閣揆就是大事了，一旦內閣大改組，能否維持目前的民意支持？若只換林佳龍，派系要如何尋求平衡？如果蘇、林都不換，就必須在「改革台鐵」上立即端出方案，並雷厲風行的執法。要選擇哪一種，考驗著蔡政府。
