交通部長林佳龍的辭呈，6日已送達行政院，但行政院長蘇貞昌仍堅持，「現在不談請辭問題，先處理善後。」根據信傳媒掌握，與林佳龍同屬黨內正國會派系的人士相當不滿，他們認為，蘇不批辭呈只是為了構築防火牆保住自己的位子，避免這把究責之火，延燒到自己身上。
不批林佳龍辭呈，正國會：蘇貞昌築防火牆
政務官沒任期，本來就必須隨時有為施政下台負責的準備，太魯閣事故傷亡太慘重，林佳龍是台鐵上級長官，勢必會遭到究責，他遞出辭呈後，下台幾乎已成定局。
只是林佳龍遞出辭呈已經好幾天，但蘇貞昌卻說「短期內不批准林佳龍辭呈，是希望林佳龍先將事故與鐵道搶通善後告一段落」，但是這背後也隱含政治考量。
知情人士透露，如果林佳龍留下來，那焦點就會在他身上，繼續成為各方砲火猛烈攻擊焦點，走了壓力才會到往上提升到蘇身上。
一位正國會人士則認為，在這種情況下，如果林佳龍還繼續留下來，蘇貞昌就不容易成為箭靶，而蘇不批辭呈是有他自己的政治盤算，「林佳龍如果不走，那才是在幫蘇貞昌擋子彈。」他說。
賴士葆：蘇貞昌要批早就批了
國民黨立委賴士葆日前在立法院質詢時，對林佳龍說，蘇貞昌若可以批馬上就會拿來批，「因為他不喜歡你啊。」他指出，台鐵3個月來都是群龍無首，難道是因為送上來的名單不是蘇貞昌的人嗎？就像財政部呈報的公股行庫董，總不是心中屬意的人選就不批。
對於台鐵局長懸缺爭議，藍委洪孟楷也質疑，是因為黨內派系鬥爭，林佳龍想找的台鐵局長，讓蘇貞昌「不滿意」。藍委萬美玲質詢時，林佳龍承認，有提報台鐵局長人選，亦有跟蘇貞昌「見面、討論過幾次」，但「真的不好找」，徵求的人，不一定人家就要來當，要找到最好的也不容易。他也強調，沒有派系問題。
新蘇系要不要拿下垂涎已久的交通部？
有沒有派系問題，並不容易度悠悠之口。從林佳龍被爆出第一時間提出請辭的對象，是蔡英文總統、而非蘇貞昌，連民進黨前立委林濁水都批評是「越級請辭」。為什麼要越級請辭？對黨內來說已是心知肚明。
民進黨的派系合作或矛盾，國民黨也知之甚詳。有政界人士認為，蘇貞昌未批准林佳龍辭呈，有很多理由，但與過去國民黨政務官堅定閃辭的最大差別，就是民進黨所掀起的輿論批判，會讓國民黨人招架不住，多待在職位上一秒鐘都是凌遲；林佳龍願意善後，還到立法院接受炮轟，勇氣可嘉。
如果走了林佳龍，蘇貞昌有可能成為下一個箭靶，尤其是台鐵的改善計畫。另外一個癥結是，新蘇系要不要一舉拿下垂涎已久、資源豐沛的交通部？果若如此，黨內派系的不均衡狀況，將更為傾斜。所以，林佳龍辭呈被「留中不批」，黨內也對新蘇系發出訊號－「顧慮派系平衡」。
在野黨提游錫堃風範，刺激蘇貞昌
對國民黨而言，林佳龍任交通部長，沒有蘇貞昌擔任閣揆來得有威脅性，在林佳龍可以掌握的政策、人事、預算等，都相較有妥協性；不過，林佳龍沒辦法，得為太魯閣號的政治責任下台，但若是蘇貞昌也下台，才能真正撼動到蔡政府。
值得注意的是，國民黨前立委陳學聖說，若蘇貞昌下台，有可能會由現任立法院長游錫堃接任。他觀察到，民進黨政治人物普遍對立法院長興趣缺缺，蘇嘉全與游錫堃都一樣想轉台，游甚至閒到去管立法院資源回收，早已明志心不在此。
陳學聖說，這次太魯閣號重大災難，提到政治責任承擔，在野黨不時捧游錫堃任行政院副院長時為「八掌溪事件」去職的風骨，來反諷蘇貞昌，而說不定也為游錫堃回鍋任行政院長添加了柴火。
若這次真的要換蘇，陳學聖認為，游循蘇為例回鍋，各派系是難有聲音的。當各方在看林佳龍何時下台時，實際上悄悄地，說不定林佳龍所屬正國會的龍頭游錫堃也準備改換舞台，以小換大，恰符合派系發展利益。
