新竹市長林智堅7月8日將正式請辭市長，轉戰桃園市參選，對手陣營已迫不及待出招，拋出林智堅在中華大學與台灣大學國家發展所碩士論文涉嫌抄襲。據指出，林智堅團隊2週前就收到風聲備戰，從昨天晚上接到記者問回應到隔天中午開記者會，10小時拆彈過程驚心動魄。
國民黨議員王鴻薇指控，林智堅2008年7月中華大學碩士發表的「以TCSI模式評估國內某科學園區之周邊居民滿意度」論文，涉嫌抄襲一份2007年12月26日科學工業管理局發標、2008年6月20日結案的「以TCSI模式評估新竹科學園區之民眾滿意度」（採購標案E961209）結案報告，連錯字都相同。
媒體人黃揚明在臉書指出，林智堅在台大國發所碩士論文「三人競選之中槓桿者的政治社會基礎及其影響以2014新竹市長選舉為例」，與比林早半年口試通過的台大國發所碩士生余正煌的論文「2014年新竹市長選舉研究：林智堅勝選的政治社會基礎」前兩章對比後發現包括摘要在內至少8、9頁內容雷同，2人論文分析原始資料也是相同的民調，整體結構幾乎相同，涉嫌抄襲。
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綠兩週前收到風聲，林智堅親上火線拆彈
林智堅今（5）中午親上火線回應，強調兩篇論文他都是原創者，中華大學碩士論文與科管局的委託案資料雷同，是因為2007年他參與該計畫，與計畫主持人是副教授李友錚、教授王明郎共同發表研究結論，隨後他於2008年6月發表論文引用。而國發所論文會與另一位碩士生余正煌有8頁雷同，是因為他將地方黨部選舉的民調資料給余引用。
林智堅也強調，他和余正煌的論文，儘管都是研究2014年新竹選舉為例、都是念國發所，但兩人論文主題不同、結論不同、研究對象不同，和結論不同，天差地別。
林智堅說，他的碩論研究台灣選舉反覆出現的「三腳督」現象。他以自己設計的問卷、蒐集得一手民調資料，作為分析的依據。但余正煌論文主題是探討「林智堅個人勝選的因素」，兩人論文方向截然不同。
林智堅說，2014年他勝選後，包括台大國發所老師和上下屆同學或學弟妹都對選情變化感到興趣，余正煌透過人介紹，向他借第一手地方黨部民調資料，並完成論文，因為自己外務較多，因此畢業時間較晚，儘管余正煌口試比他早半年，他才是原創者。
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轉戰桃園高強度選戰，藍第一波先攻論文
對於論文抄襲指控，林智堅中午也備齊教授親自簽名的聲明書，強調林智堅的確有參與科學工業管理局發包的研究案，參與問卷設計、問卷回收及資料分析等過程，也發表成果。
親近林智堅幕僚透露，早在2週前，他們就從立法院管道得知國民黨立委在找林智堅論文，以及科學工業管理局的研究案，因此也早有準備，因為過去2次新竹市選戰，時代力量打過論文爭議，大概知道對手抓的爭點在哪，藍營議員與媒體發動此題目是昨晚，他們先是被媒體問完回應後，開始備戰，果然一早報紙版面就做很大。
幕僚透露，林智堅較在意的是對教授不好意思，為了取得教授簽名証明他有加入研究計劃案，幕僚還一早跑去教授家按門鈴，希望拿到親筆聲明，有的教授已經退休，還為此事打擾。此外也要與桃園市府、立法院黨團橫向聯繫，桃園市長鄭文燦、民進黨團一早就被記者問及此事。
現在正是林智堅移交市府業務期間，加上準備跟他去桃園的市府幕僚多已經從新竹市府請辭，國民黨趁「真空」期間，打論文題，幕僚指出，雖然預料對手一定會攻擊，但這場選戰的強度遠比過去選戰還強，凸顯國民黨不論如何也要拿回桃園，也讓他們完全不敢輕忽。
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藍綠攻守桃園，成年底選戰兵家必爭
林智堅台大國發所期間的論文爭議，國安局局長陳明通主動回應媒體，直指「是余正煌拿林智堅的資料寫論文，問卷的原始設計者是林智堅及其競選團隊，怎麼寫也是我先指導林智堅。」
陳明通說，余正煌因為一開始寫的碩論計畫不理想，想換題目便找上陳明通的研究助理楊喜慧，而在陳明通徵得林智堅的同意下，將林智堅的民調資料給余正煌用，只是余正煌先畢業，因為他只剩最後一個學期，而林智堅比較晚畢業，才會讓外界誤解林智堅抄襲余正煌，「其實過程是林智堅的論文比較有原創性，真是有理說不清。」
陳明通的說法，被視為戲劇性翻轉，不過論文爭點只是藍綠攻下桃園灘頭堡的起手式，國民黨早將收復桃園市視為年底大選指標，民進黨也將守住桃園視為大選成敗關鍵，儘管國民黨桃園市長參選人張善政在確診隔離中，藍營已經發動攻勢，綠營暫時守下第一波危機，就看往後選戰藍綠如何交手過招。
