核二廠1號機在6月6日開始起動運轉，並在6月9日晚間開始併聯發電，不過在6月13日就發現溫度過高而降載解除併聯發電來做檢修。
原本也正在歲修的核三廠2號機也在6月12日下午再啟動運轉，原要在6月14日併聯發電，不過審查過程中發現現場主汽機潤滑油的馬達吸取泵發生故障，停止併聯發電，自6月15日傍晚又啟動，但尚未百分之百滿載。另外，6月1日豪雨侵襲，造成核一廠輸電塔倒塌，2號機緊急停機，已進入歲修程序。
也就是說，截至6月15日晚間六點，三個核電廠總共有6個機組，自15日傍晚開始有3個在運轉，其他都處於停機狀態，尤其核一廠更是完全停擺。
三座核電廠都是老機組
核一、二、三廠都已經服役近40年，核一廠曾被列入十大建設，而核二、三廠則是十二大建設計畫的內容。在蔡政府「2025年非核家園」的規劃下，各機組運轉執照有效年限40年，核一廠兩機組分別要在2018年底、2019年中停止運轉，緊接著是核二、三廠四座機組接續在2021、2023、2024、2025年停止運轉。
先前一度停機的核二廠1號機最近重新起動，藍營幾乎全面卯起來抨擊蔡英文「2025年非核家園」政策跳票，媽媽監督核電廠聯盟秘書長楊順美表示，蔡英文的「非核家園」政策是承諾2025年不使用核電，並沒有說要提早停止哪些機組運轉，這幾天以來核電廠的問題並不是政策跳票的問題，而是安全的問題，「這幾個機組都是老舊、而且經常出狀況的機組，在2025年全面停止運轉之前，台電和原能會應該詳細交代哪些機組是堪用的，而不是想說2025年才非核家園，在這之前就可以盡量的用。」
三個核電廠中，目前核一廠兩個機組都正在歲修，2號機是因為六月初大雨，主變壓器到開關場鐵塔的3座電塔中的1座倒塌，導致發電機、主汽機跳脫，並引動反應器急停，造成全台當時六座核電機組中一度僅剩核三廠1號在運轉。而核一廠1號機則早在2014年底就開始歲修，因為一束燃料組件有把手鬆脫情形，歲修至今仍未完成，創下全台灣核電廠機組最長歲修時間。
核二廠風波未息
核二廠1號機從一週以來經歷重新啟動，併聯發電以及解聯檢修，更添增地方居民與環保團體的不信任，雖然台電與原能會都強調，這次是因為輸電線路異常，並不影響機組安全，也與先前環團不斷抗議的裝載池改裝成貯存池無關，並且聲稱美國也有同樣的改裝案例，並不會造成核安問題。但楊順美指出，1號機去年之所以歲修不是因為故障，正是因為燃料池滿了，「不能用了就應該停止，不能再放燃料棒就應該停下來。」
雖然原能會不斷表示美國也有相同案例，不過楊順美認為，台灣核電廠燃料棒的密度比美國還要高，而且台電和原能會堅稱美國也有相同案例，這些都是15至20年前發生的事，已經沒有近10年的例子，現在美國也不太讓燃料池已滿的核電機組持續運作，因為已經知道這有很高的危險性。
另一方面，原能會6月12日也召開「核能安全管制相關作為」記者會，原能會主委謝曉星表示，預計6月底會針對核二廠2號機進行審查，並到地方上召開說明會，積極對外說明溝通。由於核二廠2號機去年5月大修完成進行併聯發電時，發生發電機跳脫情形，歲修至今，此舉也令人認為是在為未來核二廠2號機組重啟運轉鋪路。三座核電廠中，核二廠發電量占比最高，如果兩個機組全部運轉的話，可以提供7.48%的發電量。
一週重新起動兩機組
在核二廠1號機於6月6日重新起動之後，原能會也在6月7日接獲台電公司提出核三廠2號機起動申請，並於12日下午允許運轉。此舉早已引發質疑，原能會在一週內接連讓兩個機組重新起動，而後來核二廠1號機併聯發電出包，添增許多不信任。無獨有偶，核三廠2號機原本要在14日開始併聯發電，因為主汽機潤滑油的馬達吸取泵故障，馬達軸承的潤滑不良，導致驅動軸卡住。台電發言人林德福表示已經檢修完畢，將再補送資料給原能會，已經於15日傍晚運轉。
台電表示，這三次狀況皆與核反應爐、發電機無關，並非機組老舊所致，出狀況的潤滑油馬達幾乎所有工廠都有，而輸電線、電塔本來就是所有電廠都有的設備。事實上，核電廠四部機組停機在近一年來已成為「常態」，現在為了夏月供電，將腦筋再動到核能發電，待核三廠2號機滿載，終於又有一半的發電機組上軌道。
