6月21日，台鐵229次新自強號列車北上經過花蓮秀林鄉時，發生出軌意外，包括車長共9人受傷。意外發生後，行政院長卓榮泰首先為事故的發生致歉，表示政府努力的還不夠，也馬上要求交通部責令台鐵公司重新且徹底有效檢測所有告警監測系統。
台鐵將盡速完成３項重點工作
23日，交通部與台鐵緊急召開會議，擬定未來各項重點工作計畫，並決議會盡速完成3大項重點工作。首先會進行野溪疏濬整治工作，包含花蓮縣政府、農業部林業署花蓮分署、農村水保署花蓮分署、公路局等相關單位都會進行會勘，加速進行溪床疏濬整治及橋台固床護岸等工作，並於一個月內優先完成大清水溪鐵路橋河岸堆積土石疏濬及加設水位計。
另外，針對宜花東地區有經過野溪、河川的鐵路橋，會對應橋下及上下游500公尺範圍內的溪床、河床土石淤積情形，邀集相關單位勘查，盤點評估有土石溢流橋面風險的鐵路橋，全面加設水位計，並規劃分工加速進行溪床、河床疏濬整治改善工作。
再來也將會增設土石溢流告警系統以及CCTV人工監控。交通部表示，會針對大清水溪鐵路橋，研究增設溪床土石溢流橋面的告警系統示範計畫，並在7月22日前完成系統安裝啟用。另外，除了大清水溪鐵路橋以外，也會盤點評估其他有土石溢流橋面風險的鐵路橋，在各管理段增設CCTV攝影機，並24小時人工監控現場畫面，同時制定SOP，如果發生土石溢流橋面的情形，就可以立即通報、停止列車運行。
最後，臺鐵也會加速盤點宜花東地區，包括平溪線，具落石及土石流高風險的路段，規劃增設阻隔設施及告警系統，研擬整體改善計畫，循公建計畫程序，陳報交通部及行政院儘速核定辦理。臺鐵公司也表示，將依會議內容及指示事項積極落實辦理。
立委指出原有19分鐘可以避險
26日，立委洪孟楷貼出一段監視器畫面並表示，原以為這場意外是不可抗力的天災導致，但從曝光的監視器畫面中才發覺，土石流到意外發生的中間，有將近19分鐘的時間是能夠預警跟通知反應的，只要中間的環節確實執行，都能避免災害發生，每次造成交通事故都是這種低級疏失，真的要不得。
洪孟楷繼續表示，土石沖刷確實難以預判，但經過兩次重大鐵路事件後，鐵道沿線加設監視器就是希望能遠端即時監控，應該專責監看的值班人員卻在當下未發現也未通報，有將近20分鐘的反應時間白白浪費。這樣疏失真的要不得，如果心態、執行不調整，再編列多少預算也無濟於事。
對此，臺鐵公司回應，這台監視器其實是一具輔助攝影機，它的功能並不是拿來監看落石，而是在有水情時觀察大清水溪的水位，因此其畫面並非固定長時顯示於監控台上。依花蓮工務段規定，當降雨量達預警值時，監控台即應調出畫面監視。後續復查，當天1小時累積雨量僅1.0mm，遠低於預警值20mm，所以監控台未調出該畫面，也因此沒有提早發現土石流的發生。
台鐵也指出，本次事故地點發生在北迴線西正線K51+300大清水溪橋的橋上，因為該地點沒有過落石紀錄，所以未設置落石告警系統。現在已在西正線設置明隧道防範落石，並於東西正線間施作防落石柵欄等防護措施，而東正線則設置了落石告警系統。
台鐵表示，目前已經規定不論雨量多寡，該攝影機畫面都應時常調出監看以維持安全，另外，也已檢討北迴線全線土石流潛勢溪流，加裝攝影機人工監視，並設置水位計，以即時發現災情立予防範。
