世界衛生組織（WHO）於2月21日在中國北京舉行流感疫苗選株會議，但衛福部卻直到當天凌晨1點才收到邀情函，導致專家來不及參加，成為台灣自2014年受邀以來，首度缺席該會議；對此，外交部長吳釗燮除了表示遺憾外，他也說WHO有檢討的必要，而吳也透露，面對中國的政治干預，台灣恐面臨越來越大的壓力。
台灣幾個小時才收到邀請函，吳釗燮：WHO有檢討的必要
WHO根據2005年與中國簽署的秘密備忘錄，將台灣的申請轉知中國，而中國直到會議當天凌晨才送達邀請函，導致台灣專家因準備時間不足，無法出席；吳釗燮表示，WHO一直在呼籲全球不應該有任何的漏洞，所有的人應該被接納到世界衛生組織體系，但流感疫苗選株會議的行政作業卻需透過北京進行，導致台灣人民被排除在外，「這作法我們無法接受」，而WHO的確有檢討必要。
雖說台灣「臨時」收到該會議的邀請函已是家常便飯，但先前最晚都在會議前一天告知，這次拖到前幾個小時前，讓衛福部國際合作組前技監、台北醫學大學教授許明暉痛批，最誇張的一次、與不同意沒兩樣。
衛福部長陳時中也說，半夜發出邀請函的行為，擺明就是不讓台灣參與會議，他表示這種不光明的小動作很令人生氣，尤其去年流感疫苗發生一些狀況，全球僅有台灣發現，連要與國際分享、對世界貢獻一份心力也要被打壓，陳時中認為，台灣的缺席是對於國際防疫是損失。
吳釗燮：為何台灣出席需經北京同意？
今（23日）早吳釗燮面對立委詢問，雖然凌晨才收到通知，但為何不馬上買機票或提早先去當地等待時，他回答，「這是原則問題」；首先，台灣的專家、官員要參加WHO相關活動，為什麼需要中國的許可？應該是透過WHO申請參加會議，而非事事都要經過北京同意。
再來，台灣為什麼必須等到最後一刻才知道？為什麼不能提早知道有所準備？如果需要提早去當地等待、或等最後一刻被通知才買機票過去，會讓外界覺得台灣接受WHO或中國對台的矮化作法；吳釗燮也強調，已努力透過美國與其他國家跟WHO表態，認為WHO跟單一國家簽備忘錄來規範其他國家不合理。
至於今年的世界衛生大會，吳釗燮說仍然會依照進程處理，也不斷爭取理念相近國家對台灣的支持；不過流感疫苗會議事件再次凸顯中國於國際上對台灣的打壓，而吳釗燮也透露，北京當局為了轉移中國面臨的內、外交迫壓力，近期恐會加強奪取台灣邦交國。
不排斥近期與中國發生邦交爭奪戰
根據外交部送抵立院的業務報告書，台灣友邦有不少對中國存在不實際幻想的政客，導致部分邦交國有動搖的情況，不過吳釗燮強調，外交部和各大使館仍會持續全力維繫現有的17個邦交國，雖說的確感受到壓力，且有些地方必須下更多功夫，但吳認為外交部應該「守得住」。
面對今年可能與中國發生邦交爭奪戰一事，外交部表示，不會和中國做無謂的金錢競賽，但仍須積極鞏固既有的邦交關係；除此之外，外交部也會推動與非邦交國的關係，尤其是與美國、日本、歐洲、加拿大、澳大利亞、紐西蘭等理念相近的國家攜手合作。
外交部表示，也會設法化挑戰為機遇，讓中國近年來對付台灣的手段，成為台灣交朋友的管道之一，許多國家以警覺中國的各種手段，包括試圖在各地收買政治影響力、散播假新聞、駭入他國電腦系統竊密等，正在尋求因應之道，而台灣多年來都在因應中國的攻勢，並願意與他國分享這些資訊。
