台北市長柯文哲在議會質詢時，「垃圾不分藍綠」一席話在網路上瘋傳，事實上是環保署協調台北市的焚化爐協助代燒雲林縣的垃圾，而引發爭議。目前全台有在營運的垃圾焚化廠有24座，其實多個縣市的焚化爐都興建許久，垃圾處理問題在多個縣市引發爭議，環保署決定對13座焚化爐延役15年，持續配合資源回收與廚餘分類，才有退場的可能。
垃圾調度原屬地方政府工作，中央難以管理
至1980年代，台灣都還是使用掩埋場來做垃圾的最終處理，1984年內湖垃圾掩埋場發生火災，促使政府決定興建垃圾焚化爐，第一個焚化爐於1992年在內湖開始營運，也奠定「焚化為主、掩埋為輔」的政策。郝龍斌擔任環保署長期間，更喊出「一縣市一焚化爐」的政策，原本預計台灣會有36座，但因垃圾減量政策，目前僅有26座，其中只有24座在營運，花蓮、南投與離島縣市都沒有焚化爐，雲林與台東兩座焚化爐都沒有在運作，必須請其他縣市代燒。
目前營運中的焚化爐燃燒的垃圾量約是原本額度的7成，都還有餘裕，垃圾處理問題是不患寡而患不均。針對幾個沒有在使用焚化爐的縣市，若不是使用縣內的垃圾掩埋場，就是要將垃圾運到其他縣市代燒，例如台東是運往高雄、花蓮則請宜蘭代燒，大高雄的焚化爐更是協助雲林、南投、澎湖、金門等多縣市的垃圾處理。原則上，垃圾調度是屬於地方制度法的規範，中央僅有協調的功能，無法確實管理。
環保署在6月提出「建構綠能永續新世代垃圾處理計畫」，名字聽起來很文青，但事實上就是「焚化爐延役計畫」。65%的計畫經費就是用來延役13座焚化爐，也將有18億的經費用來推動區域合作，希望有10%的垃圾處理量能由中央調度，訂定相關行政契約，針對調度燃燒垃圾的縣市政府有所補助。
四都將推垃圾費隨袋徵收
台北市和新北市分別在2000年、2010年實施垃圾費隨袋徵收，使用專用垃圾袋，其餘縣市仍維持隨水費徵收。根據環保署資料，台北市在2000年時每日人均垃圾量約是1公斤，推行一年後則降為0.77公斤，去年則不到0.3公斤；新北市在2010年時是0.45公斤，隔年降為0.28公斤，去年則降到0.24公斤。從兩個縣市實施的效果可以發現，垃圾的確因為隨袋徵收政策而有明確減量。
環保署長李應元表示，明年至少再推動一個縣市實施隨袋徵收，但立委蔣萬安認為「至少一個」的速度太慢，起碼在其他四都都可以先推動。全台平均每人每天製造出0.38公斤的垃圾，除了雙北之外，其他四都幾乎都超過平均值，台南0.37公斤，台中、高雄都有0.39公斤，桃園甚至有0.5公斤。
李應元說，財源相對比較好的直轄市，實施隨袋徵收在財力上都顯得有困難，所以要分區做。高雄市、台南市、台中市等老城市擴充後城鄉差距大，做法要調整。家戶垃圾處理費用會減少，縣市政府經費也跟著減少，將跟行政院裡協調協助地方財政問題。
港湖區立委李彥秀則認為，「既然隨袋徵收這個政策那麼好，早就要在全國推動，甚至這些沒有用焚化爐的縣市是不是該優先執行？否則台北人沒有理由要一直幫其他縣市代燒垃圾。」目前沒有使用焚化爐的縣市，每日人均垃圾量也都超過平均值，雲林約0.41公斤，南投、台東都逼近0.5公斤。
垃圾大戰恐成南北大戰
焚化爐、垃圾處理問題是一個明顯「鄰避效應」，每個人都不想要焚化爐蓋在自己家旁邊，北部的立委蔣萬安、李彥秀等人都希望可以促成其他縣市的垃圾隨袋徵收政策，也質疑其他縣市的焚化爐為何不啟用。
台東環境保護聯盟廖秋娥曾表示，離島、花東、南投、雲林等以觀光、農業為主的縣市，其乾淨的環境品質是全國共同資產，是人民健康基石，焚化廠絕對不是選項。
當垃圾處理問題浮出檯面，可能是再推動垃圾分類、垃圾減量的契機；否則過去的垃圾大戰在大量興建焚化爐之後就越來越少人關心。短期上來看沒有焚化爐的縣市仍需要協調其他縣市代燒，但中長期應藉由垃圾減量、分類回收達到零廢棄，甚至補助離島與花蓮、南投、台東縣等無焚化爐縣市的垃圾轉運經費，可搭配垃圾減量與回收目標，逐年減少額度，否則跨區域的垃圾處理爭議將只增不減。
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