近來高股息ETF吸引投資人的目光，例如00919、0056及年初新募集的00939及00940，而ETF按其投資標的分為國內成分股ETF、國外成分股ETF、債券及固定收益ETF等各種類，民眾除了關注投資ETF的收益績效外，依照ETF分配收益所得歸類各有不同，也須注意相關課稅問題也不太一樣。
中區國稅局指出，根據分配收益所得歸類不同，影響納稅義務人是否需要申報、是否屬於稽徵機關提供查詢的所得資料範圍等等，也會影響是否應申報基本所得額。
ETF配息來源有3項不課稅、5項需申報
ETF配息是否要繳稅，就必須了解它配息來源為何。ETF根據追蹤的指標購買標的，標的可能是國內外股票、債券或者其他金融商品，所以ETF的配息來源多樣，可能有國內股利所得（54C ）、國內財產交易所得（76W）、收益平準金、利息所得(5A)及海外所得(71)等。
若先暫且除去大陸、海外地區所得，ETF收益分配的所得共有8個類別，其中5種ETF所得需要申報繳稅，並且稽徵機關會提供查詢的所得資料範圍，所以不必自己蒐集所得資料，分別為股利或盈餘所得／營利所得（54C）、境內金融業利息所得（5A）、境內其他利息所得（5B）、附買回債券利息所得（61D）、非固定資產租賃所得（51I），該5種ETF所得。
另外3種所得來源，國內財產交易所得（76W）、收益平準金、資本公積，雖然都不在稽徵機關提供所得資料的範圍，但它們也都不需申報繳稅。
許多民眾不太了解收益平準金，國內高配息ETF大多有平準金機制，也就是從新投入資金挪出一定比例進平準基金，避免既有配息被新進投資人的資金稀釋，簡單來說，平準金就是拿投資人本金的一部分來分配，因為不算所得，所以不用課稅。
至於國內財產交易所得（76W），主要是出售該ETF成分股所賺取的價差，由於如今「證券交易所得」停徵，因此此項無須負擔所得稅，也不必健保補充保費，可說有節稅優勢。
國內利息、股利所得超過2萬元，需扣繳2代健保補充保費
此外，若ETF配息是來自境內金融業利息所得（5A），這種一般是持有大量張數ETF的大戶才會有的報酬種類，則享有27萬元（每一申報戶） 的儲蓄投資特別扣除額；不過目前因低利率，通常金額不高，若高於2萬元 (含)以上，就需要扣繳二代健保2.11％補充保費。
至於把「境內標的」當作主要成分股的ETF，其最大宗配息來源之一是國內股利所得（54C），如0050、00878配息來源占比54C皆佔超過4成。
其課稅方式適用「2擇1制」課稅，合併申報是累進稅率5%~40%不等，分開申報股利所得要課28%，採用哪個由民眾依據所得類別跟金額來選擇，若採股利合併計稅，有8.5％可抵減稅額，每戶最高上限8萬元；並且若單次股利達2萬元(含)以上，也需要扣繳二代健保2.11%補充保費。
海外、大陸地區分配收益所得，自行備妥相關資料報稅
最後，關於大陸或海外地區的分配收益所得。大陸地區部分，有大陸地區營利所得（71）、大陸地區利息所得（73）、大陸地區財產交易所得（76）共3種，都需要申報繳稅，但不是稽徵機關提供查詢的所得資料範圍，因此民眾需要自己備妥收益分配通知書或對帳單、明細表、ETF電子帳單等。
海外的ETF分配收益所得也是3種，同樣需要自行備妥收益分配通知書等資料報稅，包含海外股利所得／營利所得（71）、海外利息所得（73）海外財產交易所得（76），根據財政部規定，海外所得合計達100萬元，應申報基本所得額，與「綜合所得淨額」合計，有670萬元扣除額度，超過就要適用20%稅率。
國稅局提醒，民眾投資ETF收益如果屬於上開地區的來源所得，請記得按收益分配通知書(或對帳單、明細表、ETF電子帳單等)所載金額自行計算，並據實申報個人綜合所得稅及基本稅額。如通知書遺失，可向各證券投資信託公司申請補發，以利完成所得稅申報。
