行政院以迅雷不及掩耳的速度宣布內閣改組，由於消息被媒體提早曝光，根據了解，一直到4日中午13：30，小英都還在跟幾位新系大老「喬」相關的內閣人事，換句話說，新內閣除了閣揆賴清德、副閣揆何美玥外，其他相關內閣閣員名單都還沒有正式敲定。
一直到下午1點多，小英都還在跟新系大老討論內閣新人事
據了解，除了內閣總辭，相關內閣閣員將會有大幅更動外，一直遭到外界詬病危機處理及戰略分析能力偏弱的國安團隊也會有大幅度更動，可以說是蔡總統上任一年四個月以來，總統府、行政院最大幅度的改組。
除了國安會成員以外，由於接下來的內閣是對準2018、2020的戰鬥內閣，所以府院黨立院之間的聯繫相當的重要，根據《信傳媒》掌握到的訊息是，行政院秘書長將會從中扮演很關鍵的角色，目前行政院秘書長的一職，民進黨副秘書長卓榮泰的呼聲很高，不過除了行政院秘書長外，高層也有意讓他接內政部長或其他更適合的位子，最後卓到底會接哪個位子，目前還不確定。
卓榮泰？行政院秘書長或內政部長
其實這次內閣總辭原本是在9月10日才要宣布，不過因為消息提前曝光，內閣名單又變動很大，一直到4日中午總統府發布聲明表示准了林全辭呈，內閣總辭之後相關新任閣員的名單都還沒有正式敲定，「就算之前談留任的閣員，現在在這樣的情況下也都可能會有變動！」知情人士透露。
過去多次傳出內閣會有異動的說法，蔡也詢問過許多人的意見，據了解，包括前瞻計畫、一例一休修法甚至上星期五（9月1日）拋出的稅改，都是蔡自己跳下來主導，就可以看出蔡其實對於林內閣的效率有所不滿，但是要不要換閣揆？什麼時候要換閣揆？小英卻是下不了決心。
根據相關人士透露，做事情一向想了又想的蔡英文，這次之所以會以如此迅速的手法更換閣揆，主要有幾個原因，首先英全的民調低迷外，再來就是這次世大運柯文哲光芒萬丈的外溢效應，讓綠營眾天王都感到威脅，所以柯文哲效應可以說是提前促成「蔡賴合」的重要要催化劑。
國安會跟著動，2018戰鬥內閣就定位
當然還另一最重要的原因，那就是2018大選。目前距離2018大選僅剩下一年的時間，以林全內閣自我定位為「政策內閣」來看，接下來恐怕難以因應的接踵而來的縣市長選舉，由於接下來的大選，需要一個很強的「政治內閣」，所以這次的內閣改組，某種程度也是為了因應2018大選，也是為了2020總統大選，提前佈好的「戰鬥選舉內閣」。
當然更深一層來看，沒有派系色彩的林全下來，換上新系的「明日之星」賴清德坐鎮，加上副閣揆何美玥也是新系大老陳菊可以接受的人選，「賴何配」某種程度代表的是蔡跟新系共治的傳聞正式檯面化，這會在民進黨各派系間引發什麼樣的效應，恐怕還有待觀察。
