數發部成立後，業務不明、預算過高、約聘人員近半，在在都引發高度質疑，業務更涵蓋NCC、國科會、經濟部等相關業務，就連要由立法院哪一個委員會來主審預算都尚未定案。
台灣民眾黨立法院黨團即召開記者會質疑，數發部是否會成為「集權老大哥」，約聘人數近半，卻沒有明確遴選機制，讓外界擔心是執政黨要花公帑養網軍。
數位發展部甫成立便爭議不斷，包括公務預算加前瞻預算高達217億元，近半為約聘人力，遭疑「養網軍」，台灣民眾黨立法院黨團今日召開記者會質疑，民眾擔心是否會變成「網軍作戰司令部」、「數位東廠」，部長唐鳳有必要就相關業務職掌，向立法院做出清楚說明。
數發部業務範圍引發爭議，翻開預算書業務內容包山包海，甚至包到外太空。首先即涵蓋國家通訊傳播委員會（NCC）所主導的無線電頻率及電信號碼配管理，研究5G通訊技術網路效能，甚至是掌握6G對行動通訊市場演進影響。
其次，是原本由國科會所主管，太空基礎能量及產業發展先期計畫，有關低軌衛星資安法規與檢測。
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數發部未來將在國內各縣市約700多處及3個國外站點，設置非同步軌道衛星設備，驗證非同步軌道衛星提供應變通訊服務的可行性。
另外，「數位產業署」則跨足經濟部業管內，要協助各產業強化物聯網，工業自動化控制及供應鏈等資通訊安全；以及要輔導跨境電商發展創新方案，推廣品牌跨國線上銷售。
張其祿憂成集權老大哥，邱臣遠：1450劣蹟斑斑
目前立法院各立委辦公室最好奇的是，未來數發部預算由哪一個委員會主責審理，經詢問後的答案是：「尚未確定」；民眾黨黨團今日即召開「看不懂的數位、資安發展藍圖？數發部應向大眾清楚說明！」記者會。
民眾黨籍立委張其祿透露，數發部長唐鳳希望是由教育及文化委員會審理；數發部上路，但是有關人事、預算，以及讓人民看不懂的多元宇宙科、民主網絡司等編制，都產生許多爭議。
張其祿稱，數發部職掌看起來「離離落落」，同時資訊公開與民眾溝通明顯不足，讓外界高度質疑，數發部是否會成為「集權老大哥」？同時網站打開，所呈現的內容也空空盪盪。
民眾黨籍立委邱臣遠質疑，數發部的200多億元預算中，有160億元是前瞻預算第四期相關業務，以及從原業務機關移撥到數發部，前瞻預算預算挪用是否符合財政紀律？
邱臣遠強調，立法院去年去年5月5日詢問，行政院當時說明編制約400位、外聘約100人，但為何才過一年多，現在約聘人員就爆增到300人。
邱臣遠質疑，過去執政黨的網軍、1450劣蹟斑斑，外界也擔心是執政黨花公帑養網軍，是否會成為總統蔡英文的「第四軍」，甚至是「數位東廠」，讓「大綠色恐怖時代」來臨。
高虹安：別給幻想的東西，唐鳳：多元宇宙共創涵融
民眾黨籍立委高虹安則強調，唐鳳有必要對人民質疑的聲明說清楚，對比NCC架構與組織職掌都很清楚，數發部的民主網絡司等單位，卻僅有短短幾行說明，看起來像是還沒有清楚的規畫。
「目前各國對元宇宙的概念尚未清楚定義，多元宇宙科還了加了『多』，當然會讓大家看不懂。」高虹安稱，相關業務說明很多都是形容詞。
高虹安強調，如果是要研究元宇宙虛擬實境，政府要思考的是協助產業界如何實現，而不是給一個幻想的東西。
唐鳳則是於1日的遠距記者會說明，「多元宇宙科」是希望通訊傳播，不再掉入單一跨境大型元宇宙裡，要達到多宇宙彼此「共創涵融」。
有關外界質疑約聘僱300人比例過高情形，唐鳳也稱，這是依據組織法編列，且受到立法院監督，擴大聘用業界專才有其必要性。
數發部編制共有6司6處2署4機構、員額600名，明年預算主要分為3筆來源。包括「數位產業署」、「資通安全署」的預算約57億元；另有各部會移撥業務預算約32億元，第3筆即為第4期前瞻預算。
