黨產會在去年11月發現，李中華曾到民生基金會於華泰銀行、永豐銀行的帳戶共提領9400萬，雖然民生基金會宣稱所提領的款項是因為業務所需，但經調查，李中華同時為國民黨黨工，讓黨產會開始著手調查民生、民族、民權與國家發展等四大基金會與國民黨的關係。
爭議1：第一桶金來自國民黨
國民黨四大基金會當中，以民生基金會歷史最為悠久，在1978年設立時，登記的財產總額是1000萬，其中就有900萬來自當時國民黨財務委員會捐贈。無獨有偶，最近剛被認定為國民黨附隨組織的欣裕台公司，也曾在2015年捐贈9000萬給民生基金會。
基金會雖然是由國民黨捐贈大部分金額設立，但在1990年代開始，民生基金會以國民黨旨於弘揚三民主義、憲政改革為由，共捐了12億給國民黨，最大筆的是1995年，整年補助6億供國民黨用於海內外宣傳。黨產會專任委員連立堅提出質疑，「民國82年有一項補助是辦理地方為民服務的工作，這明顯是政治工作，這有符合基金會公益的目的嗎？」
基金會自成立後換過好幾次會址，一開始是與中華文化總會共用，當時的建築是由文化總會與國民黨各持分二分之一，後來也曾經遷到曾為國民黨黨部的張榮發基金會現址，在民國95年之後，又變更到現今八德路國民黨黨部的位置，土地與建物都是中投所有，中投也已經在去年被認定為國民黨的附隨組織。不管是土地還是金流都與國民黨息息相關。
爭議2：人事高度重疊
根據黨產會的調查發現，李中華同時是國民黨黨工，主要薪資是由國民黨支付，但同時又在民生基金會兼職，目前基金會沒有專職的職員，民生基金會委任律師葉慶元表示，這是為了節省人事成本，也因為基金會董事長就是行管會主委邱大展，為了方便就直接雇用黨工來兼職處理基金會相關事務。
重疊的不只是基金會工作人員，每一任民生基金會的董事長，都同時擔任國民黨的黨務主管，例如第一任董事長俞國華亦是時任國民黨國民黨中央財委會的主委，最新一屆的董事長則是現任國民黨行管會主委邱大展；引人注意的是，去年5月20日黨主席改選、擔任黨職之後，邱大展在前一任董事長林祐賢的任期還沒有結束時，又旋即接任民生基金會董事長。
民生基金會的董事亦多有國民黨的黨員身分，甚至也任職於行管會，令人懷疑民生基金會的人市是否是由黨內來作指派。但邱大展表示，前任董事長林祐賢是因身體不適才請他推舉他擔任基金會董事長，並沒有任何報酬，而且「黨內山頭林立，即便董事也肩負黨職，也未必是我可以操控。」
爭議3：9400萬在哪裡？
邱大展表示，李中華之所以在11月先領出9400萬，是因為「黨產會把國民黨的資金全部凍結，讓國民黨無法動作，以往都有例行補助的款，為了怕民生基金會也會變成殭屍，所以先提領出來。」顧立雄笑問，「如果你們覺得民生基金會很獨立，為什麼還要擔心呢？」
邱大展並沒有明確回應領出來的9400萬究竟用途是什麼、是否開始花費，僅表示由董事會內部控管，「我們跟主管機關衛福部報備過，他們也沒有意見。」不過邱大展也坦承，當時是緊急提領9400萬，並沒有經過董事會開會通過。
國民黨委任律師張少騰也表示，自黨產會開始大舉調查之後，任何與國民黨有關的人民團體似乎也開始發生寒蟬效應，血液基金會受到波及即是一例，所以人民團體才會先行採取保護自己的行動。不過民生基金會大舉提領、結清銀行帳戶，究竟是寒蟬效應還是心裡有鬼，也許只有國民黨與基金會自己知道了。
